《真核微生物学期刊》The Journal of Eukaryotic Microbiology 是一份同行评审的双月刊学术期刊，专注于单细胞和简单多细胞真核生物的研究； en:is a bimonthly peer-reviewed academic journal covering research on single-celled and simple multicellular eukaryotes. 该期刊是国际原生生物学会（International Society of Protistologists）的官方出版物，目前由威立（Wiley）出版发行； en:It is the official publication of the International Society of Protistologists and is published by Wiley.
该期刊发表关于真核微生物的基础与前沿研究成果，涵盖藻类、真菌、原生动物及其寄生形式； en:The journal publishes original research and review articles on eukaryotic microorganisms, including algae, fungi, protozoa, and their parasitic forms. 其研究范围包括真核微生物的行为学、生物化学、细胞生物学、生态学、进化、遗传学、分子生物学、寄生虫学、生理学和系统分类学； en:Its subject areas encompass the behavior, biochemistry, cell biology, ecology, evolution, genetics, molecular biology, parasitology, physiology, and systematics of protists. 此外，该期刊经常刊登国际原生生物学会制定的真核生物高级分类系统共识与命名规范； en:In addition, the journal frequently publishes major consensus revisions and taxonomic guidelines on eukaryote classification formulated by the International Society of Protistologists.
该期刊由原生动物学会（Society of Protozoologists，现国际原生生物学会）于1954年创立，原名《原生动物学期刊》（The Journal of Protozoology）； en:The journal was established in 1954 by the Society of Protozoologists (now the International Society of Protistologists) under the title The Journal of Protozoology. 创刊初期为季刊，其首期于1954年2月作为伍德拉夫纪念专刊出版； en:Initially published as a quarterly, its inaugural issue debuted in February 1954 as the Woodruff Memorial Issue. 1993年，随着对单细胞真核生物进化谱系理解的拓展，期刊自第40卷起正式更名为《真核微生物学期刊》； en:In 1993, beginning with Volume 40, the journal adopted its current title, Journal of Eukaryotic Microbiology, reflecting broader evolutionary frameworks of unicellular eukaryotes. 自2005年1月起，期刊的出版工作转由威立接管； en:Beginning in January 2005, publication of the journal transitioned to Wiley. 该刊在2013年停止发行纸质印刷版，并从2014年起转为纯在线数字化形式发行； en:The journal ceased physical print production in 2013 and transitioned to an online-only digital format in 2014.
寄生虫学家威廉·特拉格（William Trager）担任了期刊的首任主编，任期从1954年至1965年； en:Parasitologist William Trager served as the journal's founding editor from 1954 to 1965. 原生动物学家约翰·O·科利斯（John O. Corliss）深度参与了创刊初期的编务，并在此后长期担任主编与管理编辑推动其发展； en:Protistologist John O. Corliss organized the journal's debut issues and subsequently guided its development as editor and managing editor. 加拿大纤毛虫学家丹尼斯·H·林恩（Denis H. Lynn）于1998年至2012年间担任总主编； en:Canadian ciliate specialist Denis H. Lynn served as editor-in-chief from 1998 to 2012. 生物化学与分子寄生虫学家罗伯托·多坎波（Roberto Docampo）随后接任总主编，主持编务直至2024年； en:Biochemist and molecular parasitologist Roberto Docampo succeeded him, serving as editor-in-chief until 2024. 演化细胞生物学家乔尔·达克斯（Joel Dacks）于2024年接棒出任该刊总主编； en:Evolutionary cell biologist Joel Dacks was appointed editor-in-chief in 2024.